Neues Werkzeug für Suche nach krankheitsrelevanten Variationen im Genom
Die genetische Grundlage von Krankheiten lässt sich jetzt leichter erforschen. Dr. Kathrin Saar und Prof. Norbert Hübner vom Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin (MDC) in Berlin-Buch haben in einem europäisch-japanischen Forschungsverbund eine Genomkarte mit über 300 verschiedenen Rattenstämmen erstellt. Das neue Werkzeug kann helfen, die Entstehung von Herz-Kreislauf-Erkrankungen oder Diabetes in Laborratten und auch beim Menschen zu verstehen.
Für die Analyse der genetischen Ursachen von Volkskrankheiten sind Laborratten besonders geeignet. Forscher nutzen Laborratten seit über 150 Jahren als Modelltier in klinischen Forschungslabors. Im Genom eines jeden Lebewesens, so auch der Laborratte, gibt es Variationen (SNPs) in der Bausteinabfolge der Erbsubstanz DNA, die sie von ihren Artgenossen unterscheiden. Wissenschaftler untersuchen diese SNPs, um zu klären, ob es Variationen im Genom gibt, die Krankheiten verursachen oder ihre Entstehung beeinflussen. Einige Millionen dieser Variationen gibt es in jedem Individuum. Die MDC-Forscher und ihre Kollegen aus dem Ausland haben jetzt drei Millionen SNPs im Rattengenom identifiziert. Sie haben damit ihr bisheriges Werkzeug, das auf der Analyse von drei Laborrattenstämmen beruhte, erheblich verfeinern können.
Originalveröffentlichung: The STAR Consortium (Kathrin Saar, Alfred Beck, Marie-Thérèse Bihoreau, Ewan Birney, Denise Brocklebank, Yuan Chen, Edwin Cuppen, Stephanie Demonchy, Paul Flicek, Mario Foglio, Asao Fujiyama, Ivo G Gut, Dominique Gauguier, Roderic Guigo, Victor Guryev, Matthias Heinig, Oliver Hummel, Niels Jahn, Sven Klages, Vladimir Kren, Heiner Kuhl, Takashi Kuramoto, Yoko Kuroki, Doris Lechner, Young-Ae Lee, Nuria Lopez-Bigas, G Mark Lathrop, Tomoji Mashimo, Michael Kube, Richard Mott, Giannino Patone, Jeanne-Antide Perrier-Cornet, Matthias Platzer, Michal Pravenec, Richard Reinhardt, Yoshiyuki Sakaki, Markus Schilhabel, Herbert Schulz, Tadao Serikawa, Medya Shikhagaie, Shouji Tatsumoto, Stefan Taudien, Atsushi Toyoda, Birger Voigt, Diana Zelenika, Heike Zimdahl & Norbert Hübner); "SNP and haplotype mapping for genetic analysis in the rat"; Nature Genetics 2008, Vol. 40, Nr. 5.
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